单细胞与空间多组学:揭秘生物学奥秘,推进精准医疗研究 | 时空简讯38期
时空简讯新视角:
随着单细胞及空间多组学技术的迅猛发展,生物医学领域迎来了海量的生物信息数据。如何精准高效地挖掘这些数据的价值,成为当前研究的热点。为此,华大时空特别策划了数据分析方法专题简讯,精选了基于单细胞分辨率的差异基因筛选、细胞类型识别等领域的代表性文章,进行深入解读,以期为研究者提供新思路。
本期聚焦:
1. 空间转录组数据细胞组成推断方法的综合比较,探讨了多种反卷积工具的性能差异。
2. 空间转录组数据分析方法的最新进展,概述了当前技术及其在不同平台上的应用。
3. 基于共变邻域的单细胞转录组分析方法,提出了一种新的表型相关亚群鉴定方法。
4. CellDART:一种新的空间转录组数据细胞类型推断方法,展示了其优越性能。
5. trendsceek:一种识别带有空间信息的高可变基因的计算方法。
6. MERINGUE:描述空间基因表达异质性的新工具。
7. MISTy:一种空间转录组细胞互作分析方法。
8. GCNG:一种基于图卷积网络的空间转录组数据基因相互作用推断方法。
9. RNALocate v2.0:更新的RNA亚细胞定位数据资源分析平台。
10. SpatialDB:首个空间解析转录组数据库的构建与功能介绍。
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